Keşmir, Can: шукати на сайті Z-Library

Can Keşmir, Dr. Ib Søndergaard, Kirsten Jensen

Рік:

2016

Мова:

english

Файл:

PDF, 541 KB

english, 2016

From image processing to classification: II. Classification of electrophoretic patterns using self-organizing feature maps and feed-forward neural networks

Журнал:

ELECTROPHORESIS

Рік:

1995

Мова:

english

Файл:

PDF, 654 KB

english, 1995

From image processing to classification: IV. Classification of electrophoretic patterns by neural networks and statistical methods enable quality assessment of wheat varieties for breadmaking

Kristen Jensen, Can Kesmir, Dr. Ib Søndergaard

Журнал:

ELECTROPHORESIS

Рік:

1996

Мова:

english

Файл:

PDF, 562 KB

english, 1996

Exploratory Study of Predicted Indirectly ReCognizable HLA Epitopes in Mismatched Hematopoietic Cell Transplantations

Geneugelijk, Kirsten, Thus, Kirsten A., van Deutekom, Hanneke W. M., Calis, Jorg J. A., Borst, Eric, Keşmir, Can, Oudshoorn, Machteld, van der Holt, Bronno, Meijer, Ellen, Zeerleder, Sacha, de Groot,

Журнал:

Helle Aagaard Bloch, Can Keşmir, Marianne Petersen, Susanne Jacobsen, Ib Søndergaard

Рік:

2019

Мова:

english

Файл:

PDF, 723 KB

english, 2019

Identification of wheat varieties using matrix-assisted laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometry and an artificial neural network

Журнал:

Rapid Communications in Mass Spectrometry

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 55 KB

english, 1999

MHC class I molecules exploit the low G+C content of pathogen genomes for enhanced presentation

Jorg J. A. Calis, Gabino F. Sanchez-Perez, Can Keşmir

Журнал:

European Journal of Immunology

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 438 KB

english, 2010

A spatial model of germinal center reactions: cellular adhesion based sorting of B cells results in efficient affinity maturation

Can Keşmir, Rob J De Boer

Журнал:

Journal of Theoretical Biology

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 476 KB

english, 2003

Clonal Exhaustion as a Result of Immune Deviation

Can Keşmir, Rob J De Boer

Журнал:

Bulletin of Mathematical Biology

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 178 KB

english, 2003

Identification of barley and rye varieties using matrix-assisted laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometry with neural networks

Helle Aagaard Bloch, Marianne Petersen, Maria Maddalena Sperotto, Can Keşmir, Louise Radzikowski, Susanne Jacobsen, Ib Søndergaard

Журнал:

Rapid Communications in Mass Spectrometry

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 166 KB

english, 2001

Variety identification of wheat using mass spectrometry with neural networks and the influence of mass spectra processing prior to neural network analysis

Helle Aagaard Sørensen, Maria Maddalena Sperotto, Marianne Petersen, Can Keşmir, Louise Radzikowski, Susanne Jacobsen, Ib Søndergaard

Журнал:

Rapid Communications in Mass Spectrometry

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 125 KB

english, 2002

Heterozygote advantage fails to explain the high degree of polymorphism of the MHC

Rob J. Boer, José A. M. Borghans, Michiel Boven, Can Keşmir, Franz J. Weissing

Журнал:

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 237 KB

english, 2004

Bioinformatic analysis of functional differences between the immunoproteasome and the constitutive proteasome

Can Kesmir, Vera Noort, RobJ. Boer, Paulien Hogeweg

Журнал:

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 488 KB

english, 2003

Definition of supertypes for HLA molecules using clustering of specificity matrices

Ole Lund, Morten Nielsen, Can Kesmir, AndersGorm Petersen, Claus Lundegaard, Peder Worning, Christina Sylvester-Hvid, Kasper Lamberth, Gustav Røder, Sune Justesen, Søren Buus, Søren Brunak

Журнал:

Nigel J. Burroughs, Rob J. de Boer, Can Keşmir

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 910 KB

english, 2004

Discriminating self from nonself with short peptides from large proteomes

Журнал:

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 176 KB

english, 2004

The role of the proteasome in generating cytotoxic T-cell epitopes: insights obtained from improved predictions of proteasomal cleavage

Morten Nielsen, Claus Lundegaard, Ole Lund, Can Keşmir

Журнал:

Xiangyu Rao, Ilka Hoof, Ana Isabel C. A. Fontaine Costa, Debbie van Baarle, Can Keşmir

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 237 KB

english, 2005

HLA class I allele promiscuity revisited

Журнал:

Journal of Biological Physics

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 641 KB

english, 2011

Modelling the Human Immune System by Combining Bioinformatics and Systems Biology Approaches

Nicolas Rapin, Can Kesmir, Sune Frankild, Morten Nielsen, Claus Lundegaard, Søren Brunak, Ole Lund

Журнал:

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 441 KB

english, 2006

The distribution of CTL epitopes in HIV-1 appears to be random, and similar to that of other proteomes

Boris V Schmid, Can Keşmir, Rob J de Boer

Журнал:

BMC Evolutionary Biology

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.02 MB

english, 2009

A Mathematical Model of Protein Degradation by the Proteasome

Luciani, Fabio, Keşmir, Can, Mishto, Michele, Or-Guil, Michal, de Boer, Rob J.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 193 KB

english, 2005

In vitro expansion of antigen-specific CD8+ T cells distorts the T-cell repertoire

Koning, Dan, Costa, Ana I., Hasrat, Raiza, Grady, Bart P.X., Spijkers, Sanne, Nanlohy, Nening, Keşmir, Can, van Baarle, Debbie

Журнал:

Journal of Immunological Methods

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 297 KB

english, 2014

A Universal Approach to Identify Permissible HLA-Mismatches in HSCT: Predicted Indirectly Recognizable HLA Epitopes

Thus, Kirsten A., Furst, Daniel, van Deutekom, Hanneke, Calis, Jorg, Borst, Eric, Kesmir, Can, Kuball, Jurgen, Mytilineos, Joannis, Spierings, Eric

Журнал:

Biology of Blood and Marrow Transplantation

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 249 KB

english, 2014

Predicted indirectly recognizable HLA epitopes presented by HLA-DR correlate with the de novo development of donor-specific HLA IgG antibodies after kidney transplantation

Otten, Henny G., Calis, Jorg J.A., Keşmir, Can, van Zuilen, Arjan D., Spierings, Eric

Журнал:

Human Immunology

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 601 KB

english, 2013

50-OR

Thus, Kirsten A., Kesmir, Can, Borst, Eric, de Weger, Roel A., Boelens, Jaap Jan, Spierings, Eric

Журнал:

Human Immunology

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 33 KB

english, 2013

Classification of Potato Varieties Using Isoelectrophoretic Focusing Patterns, Neural Nets, and Statistical Methods

Jensen, Kirsten, Tygesen, Thomas K., Keşmir, Can, Skovgaard, Ib M., Søndergaard, Ib

Журнал:

Journal of Agricultural and Food Chemistry

Рік:

1997

Мова:

english

Файл:

PDF, 102 KB

english, 1997

Complex T-Cell Receptor Repertoire Dynamics Underlie the CD8 + T-Cell Response to HIV-1

Costa, Ana I., Koning, Dan, Ladell, Kristin, McLaren, James E., Grady, Bart P. X., Schellens, Ingrid M. M., van Ham, Petra, Nijhuis, Monique, Borghans, José A. M., Keşmir, Can, Price, David A., van Ba

Журнал:

Journal of Virology

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.63 MB

english, 2015

Biomarkers in Cancer Immunotherapy

Schumacher, Ton N., Kesmir, Can, van Buuren, Marit M.

Журнал:

Cancer Cell

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 632 KB

english, 2015

Role of peptide processing predictions in T cell epitope identification: contribution of different prediction programs

Calis, Jorg J. A., Reinink, Peter, Keller, Christin, Kloetzel, Peter M., Keşmir, Can

Журнал:

Calis, Jorg J. A., de Boer, Rob J., Keşmir, Can, Peters, Bjoern

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.90 MB

english, 2015

Degenerate T-cell Recognition of Peptides on MHC Molecules Creates Large Holes in the T-cell Repertoire

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 497 KB

english, 2012

Complementarity of Binding Motifs is a General Property of HLA-A and HLA-B Molecules and Does Not Seem to Effect HLA Haplotype Composition

Rao, Xiangyu, De Boer, Rob J., van Baarle, Debbie, Maiers, Martin, Kesmir, Can

Журнал:

Hoof, Ilka, van Baarle, Debbie, Hildebrand, William H., Keşmir, Can, Peters, Bjoern

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 454 KB

english, 2013

Proteome Sampling by the HLA Class I Antigen Processing Pathway

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 375 KB

english, 2012

Estimating the Fitness Cost of Escape from HLA Presentation in HIV-1 Protease and Reverse Transcriptase

Mostowy, Rafal, Kouyos, Roger D., Hoof, Ilka, Hinkley, Trevor, Haddad, Mojgan, Whitcomb, Jeannette M., Petropoulos, Christos J., Keşmir, Can, Bonhoeffer, Sebastian, Peters, Bjoern

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 666 KB

english, 2012

Quantifying the Protection of Activating and Inhibiting NK Cell Receptors during Infection with a CMV-Like Virus

Carrillo-Bustamante, Paola, Keşmir, Can, de Boer, Rob J.

Журнал:

Carrillo-Bustamante, Paola, Keşmir, Can, de Boer, Rob J.

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.37 MB

english, 2014

A Coevolutionary Arms Race between Hosts and Viruses Drives Polymorphism and Polygenicity of NK Cell Receptors

Журнал:

Molecular Biology and Evolution

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 504 KB

english, 2015

Zooming into the binding groove of HLA molecules: which positions and which substitutions change peptide binding most?

van Deutekom, Hanneke W. M., Keşmir, Can

Журнал:

Schellens, Ingrid M.M., Navis, Marjon, van Deutekom, Hanneke W.M., Boeser-Nunnink, Brigitte, Berkhout, Ben, Kootstra, Neeltje, Miedema, Frank, Keşmir, Can, Schuitemaker, Hanneke, van Baarle, Debbie, B

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 694 KB

english, 2015

Loss of HIV-1-derived cytotoxic T lymphocyte epitopes restricted by protective HLA-B alleles during the HIV-1 epidemic

Журнал:

Schellens, Ingrid MM, Keşmir, Can, Miedema, Frank, van Baarle, Debbie, Borghans, José AM

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 398 KB

english, 2011

An unanticipated lack of consensus cytotoxic T lymphocyte epitopes in HIV-1 databases: the contribution of prediction programs

Журнал:

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 130 KB

english, 2008

Humans with chimpanzee-like major histocompatibility complex-specificities control HIV-1 infection

Hoof, Ilka, Keşmir, Can, Lund, Ole, Nielsen, Morten

Журнал:

Fontaine Costa, Ana I, Rao, Xiangyu, LeChenadec, Emmanuelle, van Baarle, Debbie, Keşmir, Can

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 115 KB

english, 2008

HLA-B molecules target more conserved regions of the HIV-1 proteome

Журнал:

de Goede, Anna L., van Deutekom, Hanneke W.M., Vrancken, Bram, Schutten, Martin, Allard, Sabine D., van Baalen, Carel A., Osterhaus, Albert D.M.E., Thielemans, Kris, Aerts, Joeri L., Keşmir, Can, Leme

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 296 KB

english, 2010

HIV-1 evolution in patients undergoing immunotherapy with Tat, Rev, and Nef expressing dendritic cells followed by treatment interruption

Журнал:

Woolthuis, Rutger G., van Dorp, Christiaan H., Keşmir, Can, de Boer, Rob J., van Boven, Michiel

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 670 KB

english, 2013

Long-term adaptation of the influenza A virus by escaping cytotoxic T-cell recognition

Журнал:

Scientific Reports

Рік:

2016

Мова:

english

Файл:

PDF, 911 KB

english, 2016

Identifying Permissible HLA-Mismatches in Unrelated-Donor Hematopoietic Stem-Cell Transplantation Using Predicted Indirectly Recognizable HLA Epitopes

Thus, Kirsten A., Geneugelijk, Kirsten, van Deutekom, Hanneke, Calis, Jorg, Borst, Eric, Kesmir, Can, Oudshoorn, Machteld, van der Holt, Bronno, Meijer, Ellen, Zeerleder, Sacha, de Groot, Marco R., vo

Журнал:

Biology of Blood and Marrow Transplantation

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 464 KB

english, 2017

Specificity of inhibitory KIRs enables NK cells to detect changes in an altered peptide environment

Carrillo-Bustamante, Paola, de Boer, Rob J., Keşmir, Can

Журнал:

Borghans, José A. M., Mølgaard, Anne, de Boer, Rob J., Keşmir, Can, Altfeld, Marcus

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 822 KB

english, 2017

P120 Predicted indirectly recognizable HLA epitopes presented by HLA-DRB1 are related to HLA antibody formation during pregnancy

Geneugelijk, Kirsten, Hoenger, Gideon, Deutekom, Hanneke, Kesmir, Can, Thus, Kirsten, Hoesli, Irene, Schaub, Stefan, Spierings, Eric

Журнал:

Human Immunology

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 28 KB

english, 2017

HLA Alleles Associated with Slow Progression to AIDS Truly Prefer to Present HIV-1 p24

Журнал:

PLoS ONE

Рік:

2007

Мова:

english

Файл:

PDF, 253 KB

english, 2007

The Specificity and Polymorphism of the MHC Class I Prevents the Global Adaptation of HIV-1 to the Monomorphic Proteasome and TAP

Schmid, Boris, Keşmir, Can, de Boer, Rob J., Nixon, Douglas F.

Журнал:

PLoS ONE

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 344 KB

english, 2008

Can Selective MHC Downregulation Explain the Specificity and Genetic Diversity of NK Cell Receptors?

Carrillo-Bustamante, Paola, Kesmir, Can, de Boer, Rob J.

Журнал:

Schellens, Ingrid M., Meiring, Hugo D., Hoof, Ilka, Spijkers, Sanne N., Poelen, Martien C. M., van Gaans-van den Brink, Jacqueline A. M., Costa, Ana I., Vennema, Harry, Keşmir, Can, van Baarle, Debbie

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 458 KB

english, 2015

Measles Virus Epitope Presentation by HLA: Novel Insights into Epitope Selection, Dominance, and Microvariation

Журнал:

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 365 KB

english, 2015

HLA Preferences for Conserved Epitopes: A Potential Mechanism for Hepatitis C Clearance

Rao, Xiangyu, Hoof, Ilka, van Baarle, Debbie, Keşmir, Can, Textor, Johannes

Журнал:

de Wit, Jelle, Borghans, José A. M., Kesmir, Can, van Baarle, Debbie

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 533 KB

english, 2015

Editorial: Role of HLA and KIR in Viral Infections

Журнал:

van Belzen, Ianthe A. E. M., Kesmir, Can

Рік:

2016

Мова:

english

Файл:

PDF, 126 KB

english, 2016

Immune biomarkers for predicting response to adoptive cell transfer as cancer treatment

Журнал: